Ece Üner, 21 Temmuz 1981 yılında İstanbul’da doğdu. Bir devir CNN Türk’te genel müdürlük yapan Şanlıurfalı Dinç Üner ve Makedonya göçmeni Ayşe Meral Üner’in kızıdır.
Koç Özel Lisesini bitirdikten sonra Koç Üniversitesi Sosyoloji ve Tarih kısımlarından 2003 yılında mezun oldu. Paris Üniversitesi’nde Fransızca lisan eğitimi, Brüksel’de ise Avrupa Birliği konusunda eğitim aldı.
Diyalog, Spikerlik ve Sunuculuk Okulunu periyot birincisi olarak bitirdi. Medya İktisadı, Dünya Medyası, Medya Tarihi ve Global Bağlantı üzerine yazıları ve tezleri bulunmaktadır.
Meslektaşı Deniz Bayramoğlu ile 2013’te evlendi. 12 yıl atletizmle uğraşan Üner’in, 1500, 3000 ve 5000 metrelerde İstanbul ve Türkiye dereceleri bulunmaktadır.